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應用案例

BeaverBeads? GSH用于純化GST標記的ZmMADS1進行后續(xù)分析

研究過程中,采用BeaverBeads? GSH純化GST標記的ZmMADS1進行后續(xù)分析,發(fā)現(xiàn)SNP-1245作為順式作用元件通過影響上游基因ZmMADS1與ZCN8的結(jié)合來調(diào)控ZCN8的表達。

中國農(nóng)業(yè)大學田豐教授等在出版于Current Biology 9.251的ZCN8的順式調(diào)控變化有助于玉米開花期的適應中得到:ZCN8是玉米中的成花素基因,是玉米開花期調(diào)控網(wǎng)絡中的關(guān)鍵整合因子。該研究團隊通過關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)ZCN8啟動子上兩個序列變異分別與花期顯著關(guān)聯(lián),證實ZCN8在調(diào)控玉米花期自然變異中發(fā)揮了重要作用。進一步群體遺傳學分析發(fā)現(xiàn),其中的序列變異SNP-1245在祖先種大芻草中已經(jīng)存在,其早開花等位基因在玉米早期馴化中受到強烈選擇,導致大多數(shù)玉米攜帶SNP-1245的早開花等位基因。

研究過程中,采用BeaverBeadsTMGSH純化GST標記的ZmMADS1進行后續(xù)分析,發(fā)現(xiàn)SNP-1245作為順式作用元件通過影響上游基因ZmMADS1與ZCN8的結(jié)合來調(diào)控ZCN8的表達。在玉米向高山地區(qū)散播過程中,來自近緣祖先種(Zea mays ssp. mexicana)的另一個早開花自然變異雜交滲入進SNP-1245早開花單倍型中,從而幫助玉米適應溫帶環(huán)境。該研究不僅首次提出了玉米花期適應過程中單個基因的逐步進化機制,也揭示了近緣種的基因滲入對提高玉米適應性的重要作用,而且進一步構(gòu)建了玉米花期適應的多基因進化圖譜,這些研究結(jié)果為其他作物的馴化和適應研究提供了重要借鑒。

 

圖 電泳遷移率變動分析(EMSA)

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